發生自體免疫性疾病，是當人體的免疫系統攻擊友好和重要的組織，如：關節，皮膚，內分泌腺，胃腸道。
一種自體免疫攻擊發生時，炎症是免疫反應的一部分，隨後有組織損傷。當組織損傷夠多時，這個組織會變得僵硬和無功能。通常，嚴重的組織損傷會伴隨著疼痛。
控制自體免疫發作，就像是處理一個移動的目標，需要不斷進行評估和調整。這是因為身體對內部環境和外部環境作持續的反應。一些狀況會抑制身體的癒合和修復。除非解決這些狀況，否則治療無法獲得進展。
狀況＃1：貧血
紅血球輸送氧氣到身體的各處。身體的每一個細胞，都需要氧氣參與細胞能量生產。貧血妨礙適當的氧氣輸送到身體。這使得腸道更難以痊癒，和內分泌系統無法平衡。
通常在一個炎症反應或持續的免疫壓力下，會耗盡尤其是垂體和腎上腺的內分泌系統，必須先解決貧血，才會有進展。貧血的原因有很多，包括自體免疫性貧血，又稱為惡性貧血。也會因為營養不足或胃腸道出血的貧血，如寄生虫感染或腸道病變時。
紅血球生產必須有鐵，葉酸，維生素B12，在飲食有關的貧血，往往缺乏這些營養素。
當你發酵任何東西，包括螺旋藻，可增加營養物質的消化率和生物利用度。由於螺旋藻可以幫助身體運送出毒素，加強免疫系統，並製造紅血球，螺旋藻列入常規飲食的一部分，可以減輕貧血，減少體內的毒性，支持免疫系統健康的好方法。
狀況＃2：血糖
如果血糖急劇上升或下降或兩者兼而有之，這是糖代謝紊亂的狀況，會使內分泌系統無法達到平衡。腸道修復和抑制一連串炎症反應，需要一個健康的內分泌系統。炎症，是自身免疫性疾病的標誌。
控制碳水化合物的攝入量，並結合適當的食物，將有助於穩定血糖，糖代謝紊亂將血糖從高至低擺動。各種嚴重血糖問題，如糖尿病，必須由合格的保健醫生解決照顧。
狀況＃3：腸道感染
寄生蟲，真菌或細菌可以引起腸道感染，對免疫系統造成壓力，引發炎症，和阻止腸道自身的癒合。有時，感染同時發生。慢性腸道感染會：
1，不斷給免疫系統壓力。
2，激活一連串炎症反應。
3，破壞腎上腺健康。
4，阻止腸道內壁的癒合。
5，擾亂消化功能。
通常，任何腸道感染，甚至快速食物中毒，會使腸道發炎和滲透性。幫助體內去除寄生蟲，停止其他感染，同時也醫治腸道內壁。
不是每個人都以同樣的方式回應微生物。例如，白色念珠菌是人體本身就有的。許多研究人員認為，一些寄生蟲或細菌，是健康的生態系統內正常的一部分，是什麼原因導致通常在身體無害的念珠菌，或其他生物變成為致病的呢？
通常這取決於你腸道以及免疫系統和內分泌系統的健康。是否要解決感染，要看它是否對你的身體造成困擾。
細菌或真菌感染，往往可以只用飲食就可控制和消除。包括每餐吃發酵的食物，和遵循健康的飲食原則。最多30天工作時，你應該開始看到一些改善。
狀況＃4：食物敏感
食物敏感不只是麥麩和酪蛋白，他們是眾所周知的炎症性疾病的罪魁禍首。食物敏感可以是我們吃的任何食物，尤其是那些經常在緊張時候吃的
食物。壓力在體內經常被認為是炎症。
一連串炎症反應被激活的時候（突然或長期的壓力），可以造成腸道滲透性，使食物顆粒進入血液。您的免疫系統將識別這些大型的食物顆粒作為侵略者和標記他們，引起免疫反應。這時就發生食物敏感。
狀況＃5：毒素
毒素是近代生活的結果。我們都會有一定程度的化學，環境和重金屬中毒的問題。不論它發展成為敏感，觸發免疫反應和破壞組織，再次依賴於身體的其他部位的健康。但是，如果毒性從來沒有完全解決，將不可能控制自體免疫疾病的炎症。
我們經常在擁擠和超載的肝臟看到毒素。這是因為肝臟是負責清除體內毒素殘賅的主要器官。要讓肝臟正常完成其工作，大腸，必須正常工作，，至少每天必須排便。
服用一些營養補充劑，有助於減輕肝臟充血，同時清腸排便。發酵食品和飲食中的有益菌，可以將有毒重金屬從身體排出，可以減輕體內毒素。有益菌也可以控制腸道內的炎症反應。
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